巩义境内河流除南部的墓坡、王瑶一带属淮河水系外，其余均为黄河水系，主要河流有伊洛河（伊、洛 两河于偃师县汇流后入巩县，故巩义段称为伊洛河，或称洛河）、黄河等10条。伊洛河境内长33公里，流域面积约 800平方公里；黄河在境内流长33公里；其余天坡河、坞罗河、后寺河、东泗河、西泗河等均为季节径流水或涌泉水。
巩义市主要属黄河、淮河两大流域。黄河流域面积1006平方千米，占全市总面积的96.64%，除过境河流黄河、伊洛河外，当地有干沟河、沙沟河、曹河、天坡河、坞罗河、后寺河、西泗河、东泗河和汜水河等河流，大部分为季节性河流。淮河流域面积35平方千米，占总面积的3.36%。巩义境内淮河水系共有三条季节河溪。鲁庄镇太子沟溪水，西流入登封少林河再入颍河;夹津口镇公川、韵沟的山涧水，东南流入登封纸纺水库经石淙河入颍河，颍河发源夹津口的韵沟，长度2.5千米，流域面积32.5平方千米;涉村镇巩登交界处分水岭诸水流入登封。
